Команда CZ Biohub под руководством Алекса Райвса (Alex Rives) выпустила открытую модель ESMFold2 для предсказания структур белков и дизайна терапевтических препаратов, а также опубликовала атлас из 6,8 млрд белковых последовательностей и 1,1 млрд предсказанных структур.
Команда CZ Biohub, входящая в состав Chan Zuckerberg Initiative, представила ESMFold2 — новую версию модели для предсказания структур белков и их взаимодействий. Модель, разработанная под руководством Алекса Райвса, научного директора CZ Biohub, демонстрирует рекордные результаты в прогнозировании взаимодействий белков, особенно антител, что критически важно для создания лекарств.
ESMFold2 построена на базе языковой модели, обученной на миллиардах белковых последовательностей. По словам Райвса, модель способна выявлять закономерности в структуре белков без предварительных знаний о биологии — лишь на основе анализа последовательностей. «Пространство представлений модели имеет композиционную организацию признаков, которая отражает понимание белковой биологии, накопленное за столетие эмпирических исследований», — отметил он.
Одним из ключевых достижений стала разработка и валидация мини-белков и одноцепочечных антител для пяти терапевтических мишеней, связанных с онкологией и иммунологией. В ходе экспериментов удалось получить связывающие белки с наномолярной и даже пикомолярной аффинностью, тестируя всего 84 варианта на каждую мишень. Увеличение вычислительных мощностей на этапе инференса повысило средний показатель успешности с 54% до 70% для мини-белков и с 12% до 21% для одноцепочечных антител.
Вместе с моделью команда опубликовала крупнейший на сегодняшний день атлас белковых структур, включающий 6,8 млрд последовательностей и 1,1 млрд предсказанных структур. Все данные и инструменты доступны под лицензией MIT, что позволяет использовать их как в коммерческих, так и в некоммерческих целях.
Райвс подчеркнул, что ESMFold2 открывает новые возможности для ускорения фундаментальных исследований и разработки лекарств. «Это шаг к созданию предсказательных моделей клеток, болезней и физиологии в целом», — заявил он в интервью подкасту *Latent Space*.
Проект получил высокую оценку коллег. Йоан Лекун (Yann LeCun), главный научный сотрудник Meta, назвал работу «потрясающей», а Джоэль Пиньо (Joelle Pineau), вице-президент Meta по исследованиям в области ИИ, отметила, что открытый доступ к моделям и данным ускорит открытия в медицине.
Источники: X-пост Алекса Райвса, 27 мая 2026; X-пост Йоана Лекуна, 27 мая 2026; блог CZ Biohub.